1. DNA和mRNA
中心法则(genetic central dogma)是分子生物学最基础的理论之一:遗传信息可通过复制(Replication)从DNA传递至DNA,可通过转录(Tranion)从DNA传递至RNA,可通过翻译(Translation)从RNA传递至蛋白质。蛋白质反过来协助上述过程(图1)。
图1:中心法则
其中DNA是存储人体遗传信息的载体。人体内绝大部分细胞都带有DNA。DNA需要转化为蛋白质才能够将遗传信息表达出来。整个DNA转化为蛋白质的过程分为两大步:第一步:DNA传递至mRNA,这一步骤称为转录(tranion),发生在细胞核内;第二步:mRNA转化为蛋白质,这一步骤称为翻译(translation),发生在细胞质中。
mRNA(信使RNA)是一种单链长核糖核酸,能够传递DNA中的遗传信息,经过翻译合成蛋白质。mRNA是DNA转化为蛋白质的中间体,mRNA相当于指令,能够指导自身细胞生产出特定的蛋白(图2)。
图2:mRNA产生特定蛋白
2.mRNA药物介绍
mRNA药物进入体内后,可以由自体细胞表达出特定的蛋白质,避免了体外因素影响;可以通过内源表达功能蛋白调节人体免疫系统,并消除包括癌细胞在内的自体威胁。相比于传统治疗,mRNA疗法具有靶向性更强,合成更简单,适应范围更广,可替代蛋白质治疗等多种优势。目前mRNA药物主要有三大应用方向,包括感染性疾病疫苗(预防性疫苗)、肿瘤治疗(治疗性疫苗)、蛋白替代疗法(治疗性药物)。
目前mRNA技术在预防性疫苗应用上较为突出,其开发速度快,应对突发性流行病学危机优势明显,同时产能爬坡速度极快,批次产量。与传统疫苗相比,mRNA疫苗具有优异的免疫激活能力,通过内源性表达抗原蛋白,可以诱导更为广泛有效的细胞免疫及体液免疫反应,产生更高的保护率。mRNA技术优势明显,将成为新型疫苗开发的重要选择。
3. mRNA的结构成分
图3:mRNA结构组成
与DNA一样,mRNA中的遗传信息包含在核苷酸序列中,这些核苷酸排列成密码子,每个密码子由三个核糖核苷酸组成。因此,通过刺激真核细胞mRNA合成机制来完成体外RNA转录,能够确保mRNA在体内的表达。所以mRNA的优化对于成功的mRNA治疗至关重要。(图4)
图4. 体外转录(IVT) mRNA及翻译起始
4. mRNA翻译和衰变
真核mRNA翻译起始是一个精细调控的过程,涉及到组装一个多蛋白及RNA复合物,指导核糖体到起始密码子。而mRNA在核糖体中会被解码,产生特定的氨基酸链。研究发现翻译过程和mRNA衰变过程之间存在一种平衡(图5)。
图5. mRNA衰变的机制
先前的研究表明,结构元件与mRNA的衰变密切相关,尤其是5 'CAP和poly(A)尾。基于这些功能元件的重要性,有大量研究集聚焦于mRNA结构的优化,如开发一系列5 '帽类似物、改变poly(a)尾长度等。
5. mRNA设计与CAP介绍
这一部对mRNA设计进行了介绍。首先介绍的是5 'CAP。mRNA 的 5' 端称为CAP的甲基化结构组成。帽决定了蛋白质合成的速率,因为没有帽的 mRNA 与核糖体的结合很差。5 '帽位于mRNA的5 '端,甲基化程度不同(图6),许多mRNA结构优化策略致力于优化帽类似物。接着介绍的是poly(A)尾。Poly(A)尾通常由10-250个腺嘌呤核糖核苷酸组成。Poly(A)尾是mRNA的动态添加物,其的长度对mRNA翻译效果和蛋白表达起着至关重要的调控作用。
介绍5′-UTRs和3′-UTRs,mRNA 3′和5′末端的UTRs不编码蛋白但在调控mRNA翻译和蛋白表达中起重要作用。UTRs参与mRNA的亚细胞定位,调节mRNA的翻译效率和稳定性。5′-UTRs和3′-UTRs共同调控蛋白质的表达水平,5′-UTRs主要参与启动翻译过程,而3′-UTRs主要影响mRNA的稳定性和半衰期。对开放阅读框(ORF)进行了介绍,ORF的设计主要集中在密码子的优化和功能肽的引入以及复制过程。
图6. 商业化和常用的Cap
5' Cap保护大部分真核细胞mRNA的5'端都有一个反式7-甲基鸟嘌呤-三磷酸核苷(m7Gppp)的起始结构,称为5'-帽结构,原核生物mRNA没有这种结构。5'-CAP结构对稳定mRNA及其翻译具有重要意义,它将5'端封闭起来,可免遭核酸外切酶水解;还可作为蛋白合成系统的辨认信号,被一种帽子结合蛋白识别并结合,促使mRNA与核糖体小亚基结合,进而启动翻译过程。mRNA不被外切酶降解,与3'端的poly A尾、poly A结合蛋白(PAPB)和翻译起始因子蛋白协同作用,起始蛋白质的翻译。体外转录(In Vitro Tranion,IVT)的加帽是常用的加帽方式,可以在IVT时加帽(即共转录加帽),也可以在IVT结束后加帽(即酶法加帽)。
应当注意mRNA可以被反向加帽,从而导致快速地降解和较低的翻译效率。为了避免反向加帽,抗反向盖帽类似物(anti-reverse cap analogs,ARCA)被开发和使用,从而确保加帽的正确性。过去的几年时间,更多的核苷酸修饰致力于使用ARCA,如新开发的Clean Cap类似物。所以,稳定的、正确方向的帽子结构应当被考虑到高效的mRNA疫苗中。
CAP结构有一个固定的组成示意图(保护基团、修饰基团、碱基序列可调整):(图7)
图7:mRNA CAP type
m7G+5',5'-triphosphate chain+the first transcirbed nucleotide
帽子结构对于mRNA来说,就像是一定钢盔,既可以保护mRNA免遭荼毒,又能够通过化学修饰在钢盔上加上烙印,便于被其他成员识别。mRNA疫苗研发中,通过共转录方式加帽,能够更加迅速提升mRNA疫苗产能。
6. 合成CAP的工艺介绍:
合成CAP的工艺路线多种,但大体路线基本一致(图8)。
图8:合成CAP工艺路线示意图
7. 所用到的基础原料(瑞博奥医药科技)
因mRNA制备中修饰基团、保护基团、序列、后期脱保护等原因,会有多种变体。以下只列出部分基础原料(图9),都可大规模提供。可继续二次组装,多次组装。
图9:CAP的部分基础原料
8.关于瑞博奥科技:
瑞博奥是专注精细化工领域,是集研发、生产和销售为一体的综合性公司,为药厂及创新药物研发机构提供产品开发、供应以及技术服务。